MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 31231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013203	TTC	2	6	253031	253036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784018
5002	NC_013203	GCC	2	6	253055	253060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257784018
5003	NC_013203	TAA	2	6	253093	253098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784018
5004	NC_013203	ATC	2	6	253232	253237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_013203	ATG	2	6	253238	253243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_013203	T	6	6	253329	253334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_013203	AAG	2	6	253358	253363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_013203	TAC	2	6	253374	253379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_013203	AAG	2	6	253380	253385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_013203	TAGT	2	8	253450	253457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_013203	CAG	2	6	253508	253513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784019
5012	NC_013203	A	6	6	253515	253520	100 %	0 %	0 %	0 %	257784019
5013	NC_013203	ATC	2	6	253522	253527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784019
5014	NC_013203	TTCG	2	8	253630	253637	0 %	50 %	25 %	25 %	257784019
5015	NC_013203	TTC	2	6	253648	253653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784019
5016	NC_013203	CTG	2	6	253702	253707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784019
5017	NC_013203	AAAT	2	8	253742	253749	75 %	25 %	0 %	0 %	257784019
5018	NC_013203	TGCATT	2	12	253796	253807	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257784019
5019	NC_013203	TA	3	6	253865	253870	50 %	50 %	0 %	0 %	257784019
5020	NC_013203	AGA	2	6	253904	253909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784019
5021	NC_013203	AGA	2	6	254012	254017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_013203	AT	3	6	254075	254080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_013203	CTTT	2	8	254176	254183	0 %	75 %	0 %	25 %	257784020
5024	NC_013203	TCC	2	6	254234	254239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257784020
5025	NC_013203	CCA	2	6	254241	254246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257784020
5026	NC_013203	TG	3	6	254247	254252	0 %	50 %	50 %	0 %	257784020
5027	NC_013203	TGT	2	6	254285	254290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784020
5028	NC_013203	ATC	2	6	254363	254368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784020
5029	NC_013203	CTT	2	6	254421	254426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784020
5030	NC_013203	CTT	2	6	254428	254433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784020
5031	NC_013203	TAA	2	6	254500	254505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784020
5032	NC_013203	TCT	2	6	254514	254519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784020
5033	NC_013203	GAGTAA	2	12	254541	254552	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257784020
5034	NC_013203	ATT	2	6	254574	254579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784021
5035	NC_013203	GAA	2	6	254589	254594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784021
5036	NC_013203	TCA	2	6	254681	254686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784021
5037	NC_013203	AG	3	6	254710	254715	50 %	0 %	50 %	0 %	257784021
5038	NC_013203	TCT	2	6	254726	254731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784021
5039	NC_013203	AGG	2	6	254749	254754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257784021
5040	NC_013203	TA	3	6	254784	254789	50 %	50 %	0 %	0 %	257784021
5041	NC_013203	GTAG	2	8	254973	254980	25 %	25 %	50 %	0 %	257784021
5042	NC_013203	CCT	2	6	255060	255065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257784021
5043	NC_013203	AGC	2	6	255115	255120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784021
5044	NC_013203	AAGAGA	2	12	255154	255165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784021
5045	NC_013203	TTG	2	6	255341	255346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784022
5046	NC_013203	CAC	2	6	255371	255376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257784022
5047	NC_013203	GTCA	2	8	255431	255438	25 %	25 %	25 %	25 %	257784022
5048	NC_013203	ACTG	2	8	255455	255462	25 %	25 %	25 %	25 %	257784022
5049	NC_013203	GCA	2	6	255564	255569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784022
5050	NC_013203	TCT	2	6	255606	255611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784022
5051	NC_013203	AGC	2	6	255644	255649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784022
5052	NC_013203	CTG	2	6	255655	255660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784022
5053	NC_013203	ACCAAG	2	12	255728	255739	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	257784022
5054	NC_013203	CAA	2	6	255775	255780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784022
5055	NC_013203	GAG	2	6	255808	255813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257784022
5056	NC_013203	GAA	2	6	255860	255865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784022
5057	NC_013203	CTG	2	6	256078	256083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784022
5058	NC_013203	TCTCC	2	10	256112	256121	0 %	40 %	0 %	60 %	257784023
5059	NC_013203	CGC	2	6	256265	256270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257784023
5060	NC_013203	TGCG	2	8	256328	256335	0 %	25 %	50 %	25 %	257784023
5061	NC_013203	TAA	2	6	256343	256348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784023
5062	NC_013203	CTG	2	6	256367	256372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784023
5063	NC_013203	TATG	2	8	256385	256392	25 %	50 %	25 %	0 %	257784023
5064	NC_013203	TTC	2	6	256413	256418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784023
5065	NC_013203	TTG	2	6	256451	256456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784023
5066	NC_013203	GC	3	6	256500	256505	0 %	0 %	50 %	50 %	257784023
5067	NC_013203	ATG	2	6	256561	256566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784023
5068	NC_013203	CTT	2	6	256585	256590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784023
5069	NC_013203	T	6	6	256589	256594	0 %	100 %	0 %	0 %	257784023
5070	NC_013203	T	6	6	256625	256630	0 %	100 %	0 %	0 %	257784023
5071	NC_013203	CTT	2	6	256658	256663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784023
5072	NC_013203	ATTC	2	8	256806	256813	25 %	50 %	0 %	25 %	257784023
5073	NC_013203	TGG	2	6	256954	256959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784023
5074	NC_013203	CTTT	2	8	257006	257013	0 %	75 %	0 %	25 %	257784023
5075	NC_013203	TCA	2	6	257068	257073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_013203	AAC	2	6	257129	257134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_013203	AAG	2	6	257150	257155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_013203	CAA	2	6	257252	257257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784024
5079	NC_013203	GTT	2	6	257326	257331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784024
5080	NC_013203	CAA	2	6	257333	257338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784024
5081	NC_013203	ATA	2	6	257367	257372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784024
5082	NC_013203	AGT	2	6	257393	257398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784024
5083	NC_013203	TGATT	2	10	257432	257441	20 %	60 %	20 %	0 %	257784024
5084	NC_013203	TTTG	2	8	257513	257520	0 %	75 %	25 %	0 %	257784024
5085	NC_013203	GTT	2	6	257635	257640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784024
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5087	NC_013203	TCA	2	6	257695	257700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784024
5088	NC_013203	TTC	2	6	257715	257720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784024
5089	NC_013203	AATA	2	8	257739	257746	75 %	25 %	0 %	0 %	257784024
5090	NC_013203	AAGA	2	8	257817	257824	75 %	0 %	25 %	0 %	257784024
5091	NC_013203	TTC	2	6	257865	257870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_013203	TAAA	2	8	257922	257929	75 %	25 %	0 %	0 %	257784025
5093	NC_013203	CCAA	2	8	257934	257941	50 %	0 %	0 %	50 %	257784025
5094	NC_013203	CAC	2	6	257997	258002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257784025
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5096	NC_013203	T	6	6	258217	258222	0 %	100 %	0 %	0 %	257784025
5097	NC_013203	CGT	2	6	258336	258341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784025
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5099	NC_013203	CT	3	6	258520	258525	0 %	50 %	0 %	50 %	257784025
5100	NC_013203	ATCC	2	8	258581	258588	25 %	25 %	0 %	50 %	257784025
5101	NC_013203	CCG	2	6	258632	258637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257784025
5102	NC_013203	TCG	2	6	258662	258667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784025
5103	NC_013203	GTAA	2	8	258706	258713	50 %	25 %	25 %	0 %	257784025
5104	NC_013203	GAAT	2	8	258743	258750	50 %	25 %	25 %	0 %	257784025
5105	NC_013203	TCA	2	6	258797	258802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784025
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5107	NC_013203	ATA	2	6	258856	258861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784025
5108	NC_013203	TGTT	2	8	258871	258878	0 %	75 %	25 %	0 %	257784025
5109	NC_013203	TTGC	2	8	258893	258900	0 %	50 %	25 %	25 %	257784025
5110	NC_013203	AAG	2	6	258929	258934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784025
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5112	NC_013203	AAAGT	2	10	258985	258994	60 %	20 %	20 %	0 %	257784025
5113	NC_013203	CAA	2	6	259030	259035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784025
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5116	NC_013203	TTC	3	9	259109	259117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784025
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5119	NC_013203	TTA	2	6	259175	259180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_013203	ATTG	2	8	259194	259201	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_013203	AAT	2	6	259227	259232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_013203	TTG	2	6	259276	259281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_013203	GCGT	2	8	259390	259397	0 %	25 %	50 %	25 %	257784026
5124	NC_013203	CAG	2	6	259438	259443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784026
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5247	NC_013203	TGA	3	9	265605	265613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784035
5248	NC_013203	TAC	2	6	265677	265682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784035
5249	NC_013203	TGC	2	6	265685	265690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784035
5250	NC_013203	ACGTT	2	10	265694	265703	20 %	40 %	20 %	20 %	257784035
5251	NC_013203	TAC	2	6	265789	265794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784035
5252	NC_013203	GGT	2	6	265819	265824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784035
5253	NC_013203	CGG	2	6	265868	265873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257784035
5254	NC_013203	TGA	2	6	265884	265889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784035
5255	NC_013203	AGT	2	6	266016	266021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784035
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5283	NC_013203	TA	3	6	267387	267392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5300	NC_013203	ATT	2	6	268258	268263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5303	NC_013203	T	7	7	268441	268447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5352	NC_013203	A	6	6	270465	270470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5353	NC_013203	CTAT	2	8	270478	270485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5354	NC_013203	ATA	2	6	270492	270497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5355	NC_013203	GTA	2	6	270528	270533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5357	NC_013203	GT	3	6	270559	270564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5358	NC_013203	GA	3	6	270597	270602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5359	NC_013203	ATGGG	2	10	270642	270651	20 %	20 %	60 %	0 %	257784040
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5370	NC_013203	TA	3	6	271061	271066	50 %	50 %	0 %	0 %	257784040
5371	NC_013203	AT	3	6	271080	271085	50 %	50 %	0 %	0 %	257784040
5372	NC_013203	GGT	2	6	271090	271095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784040
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5383	NC_013203	CTTT	2	8	271493	271500	0 %	75 %	0 %	25 %	257784040
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5391	NC_013203	TTG	3	9	271862	271870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784040
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5409	NC_013203	A	6	6	273021	273026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5410	NC_013203	TTGT	2	8	273044	273051	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5411	NC_013203	CT	3	6	273081	273086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5412	NC_013203	AT	3	6	273090	273095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5443	NC_013203	GAA	2	6	274545	274550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5444	NC_013203	TTC	2	6	274560	274565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5445	NC_013203	TGA	2	6	274696	274701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784043
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5454	NC_013203	AT	3	6	275153	275158	50 %	50 %	0 %	0 %	257784043
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5463	NC_013203	GAA	2	6	275616	275621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784043
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5483	NC_013203	AGT	2	6	276347	276352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784043
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5489	NC_013203	TCG	2	6	276746	276751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784043
5490	NC_013203	CTG	2	6	276769	276774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784043
5491	NC_013203	TGA	2	6	276800	276805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784043
5492	NC_013203	AAT	2	6	276849	276854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784043
5493	NC_013203	TGA	2	6	276890	276895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784043
5494	NC_013203	GTC	4	12	276901	276912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784043
5495	NC_013203	TTA	2	6	276955	276960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784043
5496	NC_013203	CAG	2	6	276961	276966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784043
5497	NC_013203	ACC	2	6	276996	277001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257784043
5498	NC_013203	AAT	2	6	277044	277049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784043
5499	NC_013203	CGT	2	6	277092	277097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784043
5500	NC_013203	TGT	2	6	277109	277114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784043

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